Международная группа исследователей, возглавляемая учеными из Института изучения генома (Institute for Genome Sciences, IGS), Центра биоинформатики и компьютерной биологии (Center for Bioinformatics and Computational Biology), США, идентифицировала 2 штамма холерного вибриона, по вине которого в 2010 году на Гаити вспыхнула холера. Результаты их исследования опубликованы в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS).
По словам ученых, в ходе работы им пришлось выделить и изучить огромное количество штаммов холерного вибриона в образцах, полученных от жертв холеры в 18 городах Гаити. Ученые подробно описали 76 обнаруженных геномов холерного вибриона. Полученные геномы тщательно сравнивались с имеющимися данными о штаммах-виновниках эпидемий холеры прошлых лет. В итоге им удалось идентифицировать два уже известных штамма — O1 и O139.
«Полный филогенетический анализ одной локальной вспышки холеры занимает огромное количество времени и доказывает, насколько огромно генетическое разнообразие холерных вибрионов», — говорит доктор Клэр Фрейзер (Claire Fraser), специалист по изучению генома. Исследователи подчеркивают, что их исследование еще раз доказывает необходимость создания общей современной базы геномов этого опасного возбудителя. Такая база данных будет играть важную роль в предотвращении или подавлении подобных вспышек в будущем. В дальнейшем такие базы можно было бы создать для основных возбудителей наиболее опасных инфекционных заболеваний.
Холера — заболевание, характерное для развивающихся стран, хотя вибрион холеры обитает в реках по всему миру. Вспышка холеры 2010 года в Республике Гаити вызвала огромный интерес ученых всего мира из-за своего внезапного появления и крайне интенсивного распространения. Тогда жертвами эпидемии холеры стали почти 4 тысячи человек. Как было установлено позже, штамм холерного вибриона был занесен на остров непальскими миротворцами, входящими в контингент сил ООН. По данным ВОЗ, в мире ежегодно происходит 3-5 миллионов случаев заболевания и 100-120 тысяч случаев смерти от холеры.
Ссылки по теме:
— Proceedings of the National Academy of Sciences, 18.06.2012, doi: 10.1073/pnas.1207359109
Холера пришла из Бенгальского залива — 29.08.2011
Холера перебралась с острова Гаити на континент — 27.01.2011
Количество жертв холеры на Гаити приближается к 4 тысячам — 11.01.2011
Холерный вибрион под электронным микроскопом. Фото из галереи Dartmouth Electron Microscope Facility.
|