Новости

Огромное количество исследований терпит неудачу, поскольку «не успевает» за постоянно поступающими и меняющимися научными данными. Новые исследования, проводимые по всему миру, поставляют такой огромный объем информации, который не могут обработать современные базы данных. Поэтому исследователям необходимо задуматься о создании принципиально новой глобальной информационной системы. В этом убежден Джон Бойл (John Boyle), директор отделения биоинформатики в биофармацевтической компании Kymab, Великобритания.

Большинство академических организаций путем проб и ошибок разработали свои собственные внутренние базы данных, к которым, однако, нет доступа у исследователя из другого института или другой страны. При этом количество и сложность проводимых по всему миру исследований постоянно возрастает, поставляя массу чрезвычайно важных данных. Если объединить эти данные в одну глобальную информационную систему, это избавит многих ученых от повторения чужих ошибок и поможет ускорить многие разработки. В настоящее время созданы несколько научных баз данных, однако идеальной глобальной системы хранения данных не существует.

Наиболее остро проблема нехватки такой глобальной базы стоит в геномике, убежден автор статьи. Исследования, проводимой в этой области, поставляют огромное количество информации — например, по экспрессии генов и профилю синтезируемых ими белков. И обработать весь этот массив информации может только сложная многоуровневая система. Предыдущие попытки создания глобальной базы данных провалились — но Бойл готов объяснить, почему это произошло. В частности, такие системы предполагали хранение данных в одном определенном формате, в результате чего исследователи были вынуждены переделывать большое количество информации, чтобы она соответствовала формату базы данных.

Автор уверен, что новая система должна принимать и хранить данные в любом формате — будь то всевозможные файлы, блоги или даже отсканированные записи из блокнота исследователя. Она также должна обеспечивать простой круглосуточный доступ к ним исследователей в любой точке земного шара. Но при этом такая база должна обеспечивать высочайший уровень секретности и защиты данных от посторонних глаз. Особенно важно, чтобы модель такой системы разработали не сотрудники IT-корпораций, а сами исследователи — они лучше других знают, какой именно должна быть такая база данных.

Ссылки по теме:

 — Nature, 2013. DOI:10.1038/499007a

В системах безопасности генетических баз данных обнаружена серьезная брешь — 21.01.2013

Фото © shutterstock.com